Наиболее частыми ошибками в диагностике H. Pylori являются: выполнение не тех тестов и не в то время. У каждого теста, используемого в клинической практике для диагностики данной бактерии, есть свои особенности оценки. Существуют стандартизованные тесты, которые включены в мировые и отечественные клинические рекомендации с высокой диагностической точностью. Есть тесты ориентировочные, на основании которых нельзя делать окончательный вывод. Некоторые тесты диагностически значимы только до проведения эрадикационной терапии и их выполнение после курса терапии некорректно и не дает представление об ее эффективности. Кроме того, ряд тестов должен проводиться только на фоне отмены антисекреторной и антибактериальной терапии за определённый срок до выполнения теста.